OptimumGene - 基因設計軟體
優勢
1. 有效優化複雜序列:
OptimumGeneTM 精湛的演算法可以優化高度重複序列、長序列或含大量參數的複雜序列。一鹼基重複等富含特殊結
構的複雜基因。
2. 全方位的密碼子使用頻率表適用於任何寄主:
GenScript 擁有非常完整的密碼子使用頻率表,適用於任何寄主,可用於進行基礎研究或是滿足工業需求。我們還擁有
極其可靠的生物體密碼子表,如被廣泛用於研發流程的 Pichia 和 Sf9。
3.專業設計DNA疫苗:
GenScript 提供有效的措施滿足客戶基因疫苗需求,經過 OptimumGeneTM 技術,篩選以及優化參數,調節疫苗基因
表現和免疫原性。
4. 4. 量身打造設計方案:
針對不同客戶的需求,OptimumGeneTM 基因設計系統量身訂作設計方案,提供最適合客戶的優化條件。
OptimumGeneTM 精湛的演算法可以優化高度重複序列、長序列或含大量參數的複雜序列。一鹼基重複等富含特殊結
構的複雜基因。
2. 全方位的密碼子使用頻率表適用於任何寄主:
GenScript 擁有非常完整的密碼子使用頻率表,適用於任何寄主,可用於進行基礎研究或是滿足工業需求。我們還擁有
極其可靠的生物體密碼子表,如被廣泛用於研發流程的 Pichia 和 Sf9。
3.專業設計DNA疫苗:
GenScript 提供有效的措施滿足客戶基因疫苗需求,經過 OptimumGeneTM 技術,篩選以及優化參數,調節疫苗基因
表現和免疫原性。
4. 4. 量身打造設計方案:
針對不同客戶的需求,OptimumGeneTM 基因設計系統量身訂作設計方案,提供最適合客戶的優化條件。
最優化參數
OptimumGeneTM 運算法則主要對轉錄、翻譯和蛋白折疊等多種相關參數進行優化設計。
轉錄效率: | |
GC 含量 | SD 序列 |
CpG 二核苷酸含量 | ATA box |
隱蔽剪接位點 | 終止訊號 |
陰性CpG island | |
轉譯效率: | |
密碼子偏愛性 | 抑制點位 |
GC 含量 | RNA 不穩定性基序 |
mRNA 二級結構 | mRNA 自由能穩定性 |
PolyA 早期信號 | 潛在的 Chi 序列和核糖體結合點位 |
蛋白折疊: | |
密碼子偏愛性 | 密碼子上下文關聯 |
mRNA 二級結構 | 密碼子與反密碼子交互作用 |
序列挑選: | |
針對每一個序列,OptimumGeneTM 均提供超過15000 條序列備選,再經過複雜的挑選矩陣選出最符合客戶需求的優化序列。
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